Bioinformatische Analyse genomweiter Datensätze (Z01)

Auf Next Generation Sequencing (NGS) basierende Methoden stellen heutzutage essentielle Werkzeuge zur Untersuchung aktueller Fragestellungen in der Chromatinbiologie dar. Derzeitige NGS Technologien erzeugen hunderte von Millionen Sequenzen, was das Studium von Transkriptionsfaktorbindestellen, Transkriptomen und anderen genregulatorischen Interaktionen in der Chromatinforschung auf genomweiter Ebene ermöglicht. Dieses Zentralprojekt bietet den Gruppen des TRR81 einen weitreichenden Zugang zu bioinformatischen Methoden, die zur Analyse der NGS-Daten benötigt werden. Dazu stellt es die notwendige IT-Infrastruktur zur Verfügung. Zudem berät es die Gruppen bezüglich des experimentellen Designs, analysiert die anfallenden Daten und hilft bei der anschließenden Interpretation der Ergebnisse. Weiterhin stellt das Z01-Projekt zahlreiche Schulungsangebote zur Verfügung, die Doktoranden und Postdoktoranden bioinformatische Grundkenntnisse zur Analyse ihrer eigenen NGS Daten vermitteln.

DFG-Verfahren Transregios

Teilprojekt zu TRR 81:  Chromatin-Veränderungen in Differenzierung und Malignität

Antragstellende Institution Philipps-Universität Marburg

Teilprojektleiter Professor Dr. Marek Bartkuhn; Professor Dr. Ho-Ryun Chung; Professor Dr. Alexander Goesmann