Identication of the molecular function of the wrongly annotated phosphatidylserine receptor gene (Ptdsr)
Final Report Abstract
Als ein Rezeptor für apoptotische Zellen wurde das Phosphatidylserinrezeptorprotein Ptdsr ursprünglich beschrieben. Arbeiten unseres Labors konnten zeigen, dass Ptdsr nicht an der Phagozytose apoptotischer Zellen beteiligt ist. Vielmehr handelt es sich um ein Kernprotein der Familie der 2-Oxoglutarat- und Fe2+-abhängigen Dioxygenasen. Charakteristisch für das Protein ist seine zentrale Jumonji C Domäne, die zu einer Umbennung des in seiner Funktion falsch annotierten Ptdsr-Gens in jumonji domain containing gene 6 (Jmjd6) führte. In Kooperation mit der Arbeitsgruppe von Dr. Angelika Böttger (LMU München) und der Arbeitsgruppe von Prof. Christopher Schofield (University of Oxford) konnten wir zeigen, dass Jmjd6 Lysyl-Hydroxylation der Spleißingproteine U2AF65 und CROP katalysiert. Über die Hydroxylierung der Spleißingproteine wird alternatives mRNA Spleißing durch Jmjd6 beeinflusst. Jmjd6 wird selbst auch alternativ gespleißt. Im geförderten DFG-Vorhaben konnten wir zwei neue humane und murine Jmjd6 Spleißisoformen identifizieren. Darüber hinaus konnte eine Funktion von Jmjd6 in der Demethylierung von Histonresten ausgeschlossen werden. Damit wurde Jmjd6 als erstes Jumonji-Domänenprotein identifiziert, das Spleißingprozesse regulieren kann.
Publications
- (2008): Genomic structure and expression of Jmjd6 and evolutionary analysis in the context of related JmjC domain containing proteins. BMC Genomics 9(1): 293
Hahn, P., Böse, J. and Lengeling, A.
- (2009): Jmjd6 catalyses Lysyl-hydroxylation of U2AF65 - a protein associated with RNA splicing. Science 325: 90?93.
Webby, C.J., Wolf, A., Gromak, N., Dreger, M., Kramer, H., Kessler, B., Nielsen, M.L., Schmitz, C., Butler, D.S., Yates, J.R., Delahunty, C.M., Hahn, P., Lengeling, A., Mann, M., Proudfoot, N.J., Schofield, C.J., and Böttger, A.
