Nano-HPLC/Ionenfallen-Massenspektrometer

• Subject Area: Basic Research in Biology and Medicine
• Term: Funded in 2010
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 162388456

Im MPC der RUB sind zurzeit vier Arbeitsgruppen tätig, in denen die Protein-Massenspektrometrie als Schlüsselmethode eingesetzt wird. Thematische Schwerpunkte liegen in der (i) Proteomanalyse neu-rodegenerativer Erkrankungen, (ii) in der Aufdeckung und Etablierung von Biomarkern für die (Früh-)Diagnostik von Krankheiten wie Krebs und Leberzirrhose sowie die Aufklärung grundlegender Me-chanismen der Krebsentstehung, (iii) in der Untersuchung Redox-regulierter zellulärer Prozesse („oxi-dativer Stress“), (iv) in der funktionellen Charakterisierung von subzellulären Strukturen wie Cilien, Peroxisomen und Mitochondrien einschließlich ihrer (Membran)Protein-Protein Interaktionsnetzwerke sowie (v) in der Studie sowohl des olfaktorischen Rezeptor (OR)-assoziierten Proteoms als auch OR/GPCR-vermittelter Signalprozesse. Die Arbeiten sind eingebettet in drittmittelgeförderte Projekte und/oder werden in enger Kooperation mit anderen Forschergruppen auf (inter-)nationaler Ebene durchgeführt. Die hochauflösende MS in Kombination mit der nano- HPLC und die bioinformatische Datenanalyse stellen essentielle Werkzeuge in der modernen Proteinanalyse/Proteomics dar. Neben der spezifischen und hochsensitiven Identifizierung hunderter Proteine in komplexen biologischen Systemen ermöglicht uns das hier beantragte System insbesondere die Quantifizierung von Proteinen mit Techniken des stabilen Isotopenlabellings (z.B. SILAC, iTRAQ) oder unter Einsatz markierungs-freier Methoden, die Charakterisierung posttranslationaler Modifikationen in Proteinen (Phosphorylie-rung, Cystein-Modifikationen etc.) sowie die Etablierung von Interaktionsnetzwerken (subzellulärer) Membranproteine. Aufgrund der Ausschöpfung der Messkapazitäten und/oder der nicht gleichwertigen Leistungsklasse der im MPC/RUB vorhandenen MS-Geräte, wird das hier beantrage System als eine notwendige Neuanschaffung erachtet.

• DFG Programme: Major Research Instrumentation
• Instrumentation Group: 1700 Massenspektrometer
• Applicant Institution: Ruhr-Universität Bochum
• Leaders: Professorin Dr. Katrin Marcus-Alic, since 4/2014; Professorin Dr. Bettina Warscheid, until 4/2014