Rheologie und Dynamik aktiver Biopolymernetzwerke
Subject Area
Statistical Physics, Nonlinear Dynamics, Complex Systems, Soft and Fluid Matter, Biological Physics
Term
from 2005 to 2011
Project identifier
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 13389852
Final Report Year
2008
Final Report Abstract
Im Projekt wurde die neue Materialklasse „aktives Gel" untersucht. Das untersuchte aktive Gel wird durch F-Aktin-Filamente, ein in den Zellen weit verbreitetes Biopolymer, sowie durch langlebige Vernetzer-Proteine und kurzlebige, durch aktive Motor-Komplexe erzeugte Vernetzungspunkte aufgebaut. Letztere induzieren den Transport der Filamente sowie die nichtlinearen dynamischen und elastischen Eigenschaften des Gels. Die dynamischen Eigenschaften dieses Materials wurden mit dynamischen Lichtstreumessungen untersucht. Gleichzeitig wurde ein eindimensionales Modell für dieses Filamentsystem mit zwei Klassen von Vernetzungspunkten entwickelt. Durch die Analyse des Modells wurden neue Bifurkationen sowie ein neuartiges Wechselspiel dieser Bifurkationen mit den mechanischen Eigenschaften des Systems vorhergesagt. Die damit verbundenen, neuartigen mechanosensitiven Phänomene sind Gegenstand weiterführender Untersuchungen.
Publications
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A Master Relation Defines the Nonlinear Viscoelasticity of Single Fibroblasts, Biophys. J. 90, 3796 (2006)
P. Fernández, P. A. Pullarkat, A. Ott
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Nonlinear competition between asters and stripes in filament-motor systems, Eur. Phys. J. E 18, 41 (2006)
F. Ziebert, W. Zimmermann
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On cytoskeletal patterns and intrinsic disorder effects, Nonlinear Phenomena in Complex Systems 9, 198 (2006)
F. Ziebert, M. Hammele, W. Zimmermann
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On the effects of disorder on a stationary bifurcation, Physica D 218, 139 (2006)
M. Hammele, W. Zimmermann
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Molecular motor-induced instabilities and crosslinkers determine biopolymer organization, Biophys. J. 93, 4445 (2007)
D. Smith, F. Ziebert, D. Humphrey, C. Duggan, M. Steinbeck, W. Zimmermann, J. Käs
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On hexagonal, square and stripe patterns of the ion channel density in biomembranes, Phys. Rev. E 75, 016202 (2007)
M. Hilt, W. Zimmermann
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Rheological properties of the Eukaryotic cell cytoskeleton, Phys. Rep. 449, 29 (2007)
P. A. Pullarkat, P. Fernández, A. Ott
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Shape oscillations of non-adhering fibroblast cells, Phys. Bio. 4, 268 (2007)
G. Salbreux, J. F. Joanny, J. Prost, P. Pullarkat
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Shear rheology of a cell monolayer, New. J. Phys. 9, 419 (2007)
P. Fernández, L. Heyman, A. Ott, N. Aksel, P. A. Pullarkat
DFG Programme
Research Units