Genomweite Assoziationsstudie zur molekulargenetischen Aufklärung der dilatativen Kardiomyopathie bei irischen Wolfshunden

• Applicant: Privatdozentin Dr. Ute Philipp
• Subject Area: Animal Breeding, Animal Nutrition, Animal Husbandry
• Term: from 2010 to 2013
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 125440233

Ziel des Forschungsvorhabens ist es, kausale Mutationen für die genetisch bedingte dilatative Kardiomyopathie (DCM) bei Irischen Wolfshunden (IWs) zu identifizieren. Über genomweite Assoziationsstudien mit caninen SNP-Mikroarrays sollen zunächst Genombereiche identifiziert werden, die DCM verursachende Gene enthalten. Für diese Analysen werden 160 möglichst wenig verwandte IWs aus einem Probenmaterial von rund 500 IWs ausgewählt. Die Markerdichte von etwa 127.000 SNPs ermöglicht für dieses Material eine Eingrenzung der mit DCM assoziierten Genomregionen auf ca. 500 kb bis 2 Mb. Mittels bioinformatischer Programme werden die genomweit assoziierten Regionen analysiert und genomweit assoziierte Haplotypen identifiziert. Eine weitere Auflösung der genomweit assoziierten Regionen wird durch Genotypisierung projektspezifischer SNPs erreicht. Die feinkartierten genomweit assoziierten Bereiche werden resequenziert, um die kausalen Mutationen für DCM aufzuklären. Eine Verifizierung der kausalen Mutationen von DCM erfolgt über zu IWs nah verwandten Rassen wie der Dogge und dem Deerhound.

• DFG Programme: Research Grants