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Institution

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Universität Greifswald
Institut für Mathematik und Informatik
Lehrstuhl für Bioinformatik

Adresse Walther-Rathenau-Straße 47
17489 Greifswald
Deutschland

GERiT Diese Institution in GERiT

17489 Greifswald

Projekte

Sachbeihilfen
- laufende Projekte
  - AI-GUSTUS: Eine cloud-native Pipeline für genaue Genom-Annotation
    (Antragstellerin Hoff, Katharina )
  - Deep Learning von Proteinfamilien und Multiplen Sequenzalignment
    (Antragsteller Stanke, Mario )
  - Ein reguläre Grammatiken berücksichtigendes tiefes Seq2seq-Grundlagenmodell für Genome und Genomannotation
    (Antragsteller Stanke, Mario )
- abgeschlossene Projekte
  - Automatic Localization of Complete Protein Coding Genes in Eukaryotic Genomes
    (Antragsteller Stanke, Mario )
  - Classification of HIV-1 Using Coalescent Theory
    (Antragsteller Stanke, Mario )
  - Reliable structural genome annotation of Archaea
    (Antragstellerin Hoff, Katharina )
  - Structural genome annotation and quantification of transcripts based on ultra-high-throughput transcriptome sequencing
    (Antragsteller Stanke, Mario )
  - Verbesserung der Vorhersage neuer Mitglieder von Proteinfamilien in eukaryotischen Genomen am Beispiel der Analyse der Kinesin-Motorproteine
    (Antragsteller Kollmar, Martin ; Waack, Stephan )
Forschungsgruppen
- abgeschlossene Projekte
  - A comparative approarch to genome annotation in Tribolium
    (Antragsteller Stanke, Mario )
  - Mechanismen des Polysaccharid-Abbaus in Partikel-assoziierten mikrobiellen Gemeinschaften
    (Antragstellerinnen / Antragsteller Harder, Jens ; Hoff, Katharina )
Forschungsstipendien
- abgeschlossene Projekte
  - Verbesserung des eukaryotischen Genvorhersageprogramms AUGUSTUS
    (Antragsteller Stanke, Mario )
Forschungsdaten und Software
- abgeschlossene Projekte
  - GAIUS - Wartungsarbeiten für die Nachhaltigkeit von AUGUSTUS
    (Antragsteller Herbold, Steffen ; Stanke, Mario )
Schwerpunktprogramme
- laufende Projekte
  - Aufdecken der genomischen Innovationen bei der Entstehung von Holometabolie
    (Antragsteller Bucher, Gregor ; Stanke, Mario )
  - Gen- und Genomduplikation und phänotypische Neuerungen – Erkenntnisse aus Spinnen und Insekten
    (Antragstellerinnen / Antragsteller Pechmann, Matthias ; Posnien, Nico ; Prpic-Schäper, Nikola-Michael ; Turetzek, Natascha )
Graduiertenkollegs
- abgeschlossene Projekte
  - GRK 1870: Bakterielle Atemwegsinfektionen - Allgemeine und spezifische Mechanismen der Adaption von Pathogenen und der Immunabwehr
    (Sprecher Hammerschmidt, Sven )

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